 | DİKKAT: ANSYS Programı ücretli bir program olduğu için sınırlı sayıda lisans ile temin edilebilmiştir. Ansys programının, çok başarılı ve ücretsiz kullanılabilecek alternatifleri mevcuttur. OpenFOAM ve SU2 gibi tüm dünyada çok yaygın olarak kullanılan alternatif programları kullanmanız size her zaman ve her yerde, dilediğiniz sürümü ile, dilediğiniz ölçek ve sayıda hesaplama yapabilme özgürlüğü verir.
Örneğin, UHeM'de Ansys programı ile, sadece 17.2 ve 18.2 sürümleri ile, toplamda 512 işlemci kullanan 5 Ansys kopyası açılabildiği için kullanıcılarımız sürekli lisansın boşalmasını beklemektedirler. Halbuki OpenFoam kullanıcıları, diledikleri OpenFoam sürümünü UHeM'de mevcut tüm bilgisayarları kullanarak, diledikleri ölçek ve sayıda kullanabilmektedirler. İsterlerse, OpenFoam'ı kendi evlerinde yada ileride çalışacakları şirketlerde de sınırsız kullanabilirler. OpenFOAM Kullanım Kılavuzu |
Altay kümesinde komut satırından paralel Fluent (2022 R2 sürümü) çalıştırmak
ANSYS 2022 R2 sürümü 5 kullanıcı (programın 5 kopyası) ve 512 parallel lisansı ile temin edilmiştir. Kullanmak için örnek slurm betiğini, /ari/progs/slurm_betikleri/fluent-2022R2.sh adresinde bulabilirsiniz.
ANSYS yazılımının işletim sistemi gereksinimleri sebebiyle, ANSYS 2022 R2 yazılımı sadece altay kümesinde çalışabilmektedir. Bu sebeble sariyer kümesine ANSYS 2022 R2 sürümü kurulamamaktadır. Aynı şekilde, ANSYS 17.2 ve 18.2 sürümleri de altay kümesinde çalışamamaktadır. Bu sürümler, sadece sarıyer kümesinde çalışmaktadır.
Altay kümesinde Grafik Arabirim (GUI) ile Fluent (2022 R2 sürümü) çalıştırmak
Altay kümesinde Ansys Fluent programının grafik arabirimine x2goclient programı aracılığı ile ulaşmak mümkündür. Bu konuda gerekli bilgiler Sarıyer sistemine iş vermek#Sariyer Kümesine Grafik Arabirim Kullanarak Erişmek sayfasında açıklanmıştır.
Grafik Arabirim insanlara daha kolay ve çekici gelse de bilgisayarlar için ilave bir yüktür ve işlerinizin çalışmasını yavaşlatacaktır. Bu sebeble gerçekten gerekmedikce grafik arabirimi kullanmayınız ve komut satırını kullanarak işlerinizi çalıştırmanızı tavsiye ederiz.
Grafik arabirim kullanırken açacağınız Ansys Fluent de lisans kullanacaktır. Mevcut lisanslar meşgul ise, lisans hatası vererek çalışmayı reddedecektir. Bu sebeble gerekmedikce grafik arayüzü kullanmayınız ve grafik arayüzü açık bırakmayınız.
Lisans durmunu scontrol show licenses komutu ile kontrol edebilirsiniz:
$ scontrol show licenses
LicenseName=ansys@flex7
Total=5 Used=0 Free=5 Reserved=0 Remote=yes
LicenseName=ansysedt@flex7
Total=10 Used=0 Free=10 Reserved=0 Remote=yes
LicenseName=ansyspar@flex7
Total=632 Used=0 Free=632 Reserved=0 Remote=yes
Örneğin 2 makinada (256 çekirdek), defq kuyruğunda ve hsaat projemizi kullanarak interaktif olarak fluent çalıştıralım. -L parametresi ile lisans bilgisini veriyoruz ki lisans sorunu yaşamayalım:
[mercan@altay ~ ]$ salloc -n 256 -N 2 -A hsaat -p defq -L ansys@flex7,ansyspar@flex7:256
salloc: Granted job allocation 26819
[mercan@altay ~ 26819]$ sunucular
a006 a009
[mercan@altay ~ 26819]$ srun hostname -f >SUNUCULAR.txt
[mercan@altay ~ 26819]$ ssh -X a006
Last login: Wed Sep 28 12:23:04 2016
[mercan@a006 ~ ]$ module load ANSYS/Fluent2022R2
[mercan@a006 ~ ]$ fluent -cnf=./SUNUCULAR.txt -pib -ssh -mpi=intel
/ari/progs/ANSYS/ANSYS2022R2/ansys_inc/v222/fluent/bin/fluent -r22.2.0 -cnf=./SUNUCULAR.txt -pib -ssh -mpi=intel
[mercan@a006 ~ ]$ logout
Connection to a006 closed.
[mercan@altay ~ 26819]$ exit
salloc: Relinquishing job allocation 26819
[mercan@altay ~ ]$
Yukarıdaki örnekte SUNUCULAR.txt dosyasında bize ayrılan sunucuların adları bulunuyor. -cnf=./SUNUCULAR.txt -pib -ssh -mpi=intel parametrelerini fluent açıldıktan sonra "show more options" seçeneğini tıklayıp, "parallel settings" bölümünden de verebilirsiniz:
Ancak bu parametreleri komut satırından verdiğimizde, açılan fluent penceresindeki ilgili yerler dolu gelecek, uğraşmayacağız. Artık simulasyonlarınız ayırdığınız bu makinaları kullanacak. Ancak şuna dikkat ediniz: Bu makinalar, sariyer loginnode'da kullanıcı adınızın yanında işnumarasının gözükmesinden başlayarak, yukarıdaki örnek çıktıdaki gibi salloc: Relinquishing job allocation 268194 mesajı görülene kadar size fatura edilmeye devam edilecektir.
Sariyer kümesinde komut satırından paralel Fluent (17.2 ve 18.2 sürümleri) çalıştırmak
ANSYS 17.2 ve 18.2 sürümü için iki farklı lisans edinilmiştir:
1. Lisans: 5 kullanıcı (programın 5 kopyası) ve 512 işlemcili lisans:
#SBATCH -L ansys@flex5,ansyspar@flex5:56
export ANSYSLI_SERVERS=2325@10.128.1.205
export ANSYSLMD_LICENSE_FILE=1055@10.128.1.205
2. Lisans: 5 kullanıcı (programın 5 kopyası) ve 1024 işlemcili lisans:
#SBATCH -L ansys2@d192,ansys2par@d192:56
export ANSYSLI_SERVERS=2325@10.128.1.192
export ANSYSLMD_LICENSE_FILE=1055@10.128.1.192
İlk alınan lisans (512 işlemcili) flex5 lisans sunucusunu kullanmaktadır ve genelde slurm betikleri bu lisansı kullanacak şekilde yazılmıştır. İkinci lisansı kullanmak için slurm betiklerindeki, yukarıda 1. lisans bölümünde gösterilen satırlar, 2. lisans bölümünde gösterilen satırlar ile değiştirilmelidir.
| DİKKAT: ANSYS 17.2 yazılımı core40q makinalarında yüklü bulunan Centos 7.3 ile uyumlu değildir:
https://www.ansys.com/-/media/ansys/corporate/files/pdf/solutions/it-professionals/platform-support/platform-support-by-application-172.pdf?la=en |
sariyer makinasında, komut satırından fluent işi teslim etmek için öncelikle bir slurm betiği hazırlamalıyız. Aşağıdaki betiği /okyanus/progs/slurm_betikleri/fluent-17.2.sh (18.2 için /okyanus/progs/slurm_betikleri/fluent-18.2.sh) adresinde bulabilirsiniz. Buradan kendi dizininize kopyalayıp, gerekli yerlerini değiştiriniz (Nasıl değişiklik yapabileceğiniz konusunda Login Sunucularında Dosya İçeriğini Değiştirme sayfasında bulabilirsiniz):
#!/bin/bash
# UHeM, 04/01/2017, Fluent Slurm Betigi
#SBATCH -A hsaat # account / proje adi
#SBATCH -N 2 # makina sayisi
#SBATCH -n 56 # toplam cekirdek / islemci sayisi
#SBATCH -p defq
#SBATCH -J "Fluent-17.2"
#SBATCH -L ansys@flex5,ansyspar@flex5:56 # lisans isteniyor, buradaki sayi kullanilan cekirdek sayisi ile ayni olmali
# -----------------------------------------------------------------
# Bu satirlari degistirmeyiniz - BASLANGIC
# -----------------------------------------------------------------
export PATH=/okyanus/progs/ANSYS/ANSYS172_LINX64/ansys_inc/v172/fluent/bin:$PATH
HOSTSFILE=.hostlist-job$SLURM_JOB_ID
srun hostname -f > $HOSTSFILE
# -----------------------------------------------------------------
# Bu satirlari degistirmeyiniz - BITTI
# -----------------------------------------------------------------
SOLVER=3ddp #Fluent Solver versiyonu 2d, 2ddp, 3d, 3ddp gibi
JOURNALDOSYASI=JournalFile.jou #Fluent Journal dosyasi
CIKTIDOSYASI=CiktiDosyasi.out #Ekrana yazilacaklarin kaydedilecegi cikti dosyasi
export ANSYSLI_SERVERS=2325@10.128.1.205
export ANSYSLMD_LICENSE_FILE=1055@10.128.1.205
fluent -v$SOLVER -g -t $SLURM_NTASKS -cnf=$HOSTSFILE -pib -ssh -i ./$JOURNALDOSYASI >./$CIKTIDOSYASI.$SLURM_JOB_ID
# -----------------------------------------------------------------
# Bu satiri degistirmeyiniz
# -----------------------------------------------------------------
rm -f $HOSTSFILE
Bu betik aşağıdaki gibi çalıştırılır:
sbatch fluent-17.2.sh
Bu betikte gördüğünüz Fluent Journal Dosyası, temelde fluent programını açıp, fare ile seçtiğmiz, çalıştırdığımız, açıp yüklediğimiz, vb. işlemlerin karşılığı olan komutların bir dosyaya okunabilecek şekilde yazılmasından ibarettir. Bu dosyayı hazırladığımızda bizim fluent programındaki menülerden işlemleri fare ile tıklayarak çalıştırmamız karşılığı olan komutlar ardı ardına bir dosyaya yazılmış olacaktır. Örneğin "şuradaki case dosyasını yükle, sonra şu hesaplamayı yap, sonrada sonuçları şu dosyaya kaydet" şeklinde bir tarif bu dosyada bulunacaktır. Fluent'i bu journal dosyası ile çalıştırdığımızda, fluent penceresi açılmadan, journal dosyasındaki tüm hesaplamalar otomatik olarak yapılıp sonuçlar kaydedilebilecektir. İnternette yada Ansys Fluent dökümanlarında nasıl journal dosyası hazırlanacağına ait bilgiler mevcuttur. Aşağıda journal dosyasına bir örnek bulabilirsiniz:
; Read case file
rc example.cas
; Initialize the solution
/solve/initialize/initialize-flow
; Calculate 50 iterations
it 50
; Write data file
wd example50.dat
; Calculate another 50 iterations
it 50
; Write another data file
wd example100.dat
; Exit Fluent
exit
yes
; Bu ornek https://www.sharcnet.ca/Software/Ansys/16.2.3/en-us/help/flu_gs/flu_ug_sec_batch_execution_unix.html adresinden alinmistir
http://ansysofkemin.blogspot.com/2018/05/tui-fluent.html#org034a430 adresinde de journal dosyası konusunda ilave bilgiler bulabilirsiniz.
Sariyer kümesinde Grafik Arabirim (GUI) ile Fluent (17.2 ve 18.2 sürümleri) çalıştırmak
Sariyer kümesinde Ansys Fluent programının grafik arabirimine x2goclient programı aracılığı ile ulaşmak mümkündür. Bu konuda gerekli bilgiler Sarıyer sistemine iş vermek#Sariyer Kümesine Grafik Arabirim Kullanarak Erişmek sayfasında açıklanmıştır.
Grafik Arabirim insanlara daha kolay ve çekici gelse de bilgisayarlar için ilave bir yüktür ve işlerinizin çalışmasını yavaşlatacaktır. Bu sebeble gerçekten gerekmedikce grafik arabirimi kullanmayınız ve komut satırını kullanarak işlerinizi çalıştırmanızı tavsiye ederiz.
Grafik arabirim kullanırken açacağınız Ansys Fluent de lisans kullanacaktır. Mevcut lisanslar meşgul ise, lisans hatası vererek çalışmayı reddedecektir. Bu sebeble gerekmedikce grafik arayüzü kullanmayınız ve grafik arayüzü açık bırakmayınız.
Lisans durmunu scontrol show licenses komutu ile kontrol edebilirsiniz:
$ scontrol show licenses
LicenseName=ansys2@d192
Total=5 Used=1 Free=4 Remote=yes
LicenseName=ansys2par@d192
Total=1024 Used=280 Free=744 Remote=yes
LicenseName=ansys@flex5
Total=5 Used=5 Free=0 Remote=yes
LicenseName=ansyspar@flex5
Total=512 Used=248 Free=264 Remote=yes
LicenseName=matlab@flex5
Total=10 Used=0 Free=10 Remote=yes
LicenseName=matlabpar@flex5
Total=128 Used=0 Free=128 Remote=yes
Örneğin 2 makinada (56 çekirdek), shortq kuyruğunda ve hsaat projemizi kullanarak interaktif olarak fluent çalıştıralım. -L parametresi ile lisans bilgisini veriyoruz ki lisans sorunu yaşamayalım:
[mercan@sariyer ~ ]$ salloc -n 56 -N 2 -A hsaat -p shortq -L ansys@flex5,ansyspar@flex5:56
salloc: Granted job allocation 268194
[mercan@sariyer ~ 268194]$ sunucular
s006 s076
[mercan@sariyer ~ 268194]$ srun hostname -f >SUNUCULAR.txt
[mercan@sariyer ~ 268194]$ ssh -X s006
Last login: Wed Sep 28 12:23:04 2016
[mercan@s006 ~ ]$ module load ANSYS172/fluent
[mercan@s006 ~ ]$ fluent -cnf=./SUNUCULAR.txt -pib -ssh -mpi=intel
/okyanus/progs/ANSYS/ANSYS172_LINX64/ansys_inc/v172/fluent/fluent17.2.0/bin/fluent -r17.2.0 -cnf=./SUNUCULAR.txt -pib -ssh -mpi=intel
[mercan@s006 ~ ]$ logout
Connection to s006 closed.
[mercan@sariyer ~ 268194]$ exit
salloc: Relinquishing job allocation 268194
[mercan@sariyer ~ ]$
Yukarıdaki örnekte SUNUCULAR.txt dosyasında bize ayrılan sunucuların adları bulunuyor. -cnf=./SUNUCULAR.txt -pib -ssh -mpi=intel parametrelerini fluent açıldıktan sonra "show more options" seçeneğini tıklayıp, "parallel settings" bölümünden de verebilirsiniz:
Ancak bu parametreleri komut satırından verdiğimizde, açılan fluent penceresindeki ilgili yerler dolu gelecek, uğraşmayacağız. Artık simulasyonlarınız ayırdığınız bu makinaları kullanacak. Ancak şuna dikkat ediniz: Bu makinalar, sariyer loginnode'da kullanıcı adınızın yanında işnumarasının gözükmesinden başlayarak, yukarıdaki örnek çıktıdaki gibi salloc: Relinquishing job allocation 268194 mesajı görülene kadar size fatura edilmeye devam edilecektir.